根据培养基的用途来区分，可分为选择培养基、增殖培养基、鉴别培养基等。

1）杀死或抑制不想要的植物生长培养基的选择性培养基添加物质的介质，介质的选择。如链霉素，氯霉素抑制原核微生物的生长；制霉菌素，灰黄霉素能抑制真核微生物的生长；结晶紫能抑制革兰氏阳性细菌的生长。结晶紫能抑制革兰氏阳性细菌的生长。

2）自然增殖培养基，不同种类的微生物往往生活在一起，为了将我们需要加一些特殊的微生物，在介质中的微生物对营养物质的爱，以增加该生物的繁殖率，并逐步消除其他微生物，这种介质称为介质的扩散介质，用于筛选和选择性富集。在某种程度上是一种选择性培养基，增殖培养基。

3）一些试剂或化学介质的文化附加鉴别培养基，培养基表现出明显的差异是很难区分的，从而帮助某些微生物的快速鉴定。这样的媒体称为分化培养基。例如，检查水和乳制品中的肠道致病菌，伊红美蓝琼脂的存在是一种歧视性的普通培养基。